Khóm là loại cây trồng có giá trị xuất khẩu cao, được trồng với một diện tích lớn (>14.000 ha) ở vùng đất phèn thuộc huyện Tân Phước, tỉnh Tiền Giang. Để tiến tới một nền nông nghiệp bền vững với một sản phẩm đạt tiêu chuẩn Global-GAP, tỉnh Tiền Giang đã và đang đầu tư một dự án hộ trợ cho nông dân trồng khóm ở vùng Tân Phước. Vì thế việc nghiên cứu những vi khuẩn nội sinh, xác định và đánh giá một số đặc tính tốt như cố định đạm sinh học, hòa tan lân khó tan, sinh tổng hợp kích thích tố tăng trưởng thực vật như IAA của dòng vi khuẩn nội sinh này để ứng dụng những vi khuẩn nội sinh tốt cho cây trồng nói chung và cây khóm nói riêng như dạng phân sinh học trong tương lai.

Vật liệu dùng trong nghiên cứu là cây khóm (Ananas comomosus [L.] Merr) được thu từ các ruộng khóm trồng lâu năm trong vùng chuyên canh thuộc mười hai xã trong huyện Tân Phước, tỉnh Tiền Giang.

Bốn mươi chín dòng vi khuẩn được phân lập từ rễ, thân, lá của cây khóm (Ananas comomosus [L.]) trồng trên đất phèn huyện Tân Phước. Ba mươi ba dòng vi khuẩn được xác định là vi khuẩn nội sinh bằng kỹ thuật PCR 16S-rDNA và 19 dòng vi khuẩn nhận diện cặp mồi RB-RM. Giải trình tự 15/19 dòng vi khuẩn nội sinh và sử dụng phần mềm BLASTN để so sánh trình tự các dòng vi khuẩn có trong ngân hàng dữ liệu NCBI. Kết quả cho thấy 9 dòng có tỉ lệ đồng hình với dòng EM_PRO EF622219 Burkholderia tropica CICC_10348, EU72341 Burkholderia tropica Tat 0750 và EM_PRO AF 164045 Burkholderia tropicalis AB98 là 99%, 99,1 và 100%, theo thứ tự, còn lại là các giống Klebsiella, Enterobacter, Laminoella và Acinetobacter. Tất cả 9 dòng Burkholderia đều có cả 3 đặc tính tốt như cố định đạm, hòa tan lân và tổng hợp IAA nhưng hai dòng Bur.7 [dòng TL1-1R] và Bur.8 [dòng MP-L] là hai dòng vi khuẩn tốt nhất, đặc biệt tổng họp nhiều enzyme nitrogenase trong cây khóm con cấy mô.